Ένας ποδοσφαιριστής που μεγάλωσε στον ΠΑΟΚ, καθώς εκπαιδεύτηκε από μικρή ηλικία στις ακαδημίες του, επιστρέφει για να ενισχύσει την αμυντική γραμμή του ΠΑΟΚ Β. Στα 26 του ο αριστεροπόδαρος κεντρικός αμυντικός Φώτης Παντεκίδης είναι μια αξιόπιστη και έμπειρη λύση στα μετόπισθεν.

Το 2016, όντας ήδη επαγγελματίας στον ΠΑΟΚ, δόθηκε δανεικός στον Αιγινιακό και την επόμενη σεζόν συνέχισε με δανεισμό στον Μακεδονικό και την ΑΠΕ Λαγκαδά. Στην Football League έπαιξε με την Τρίγλια την σεζόν 2019-20, ενώ την αμέσως επόμενη αγωνιστική περίοδο συνέχισε με πολύ καλή παρουσία στην Καβάλα. Μετακόμισε στα Χανιά, με τα οποία κατέγραψε 19 συμμετοχές στην Super League 2, ενώ παρόμοια πορεία έκανε και την σεζόν 2022-23 στον Πανσερραϊκό με 18 συμμετοχές κι ένα γκολ.

Έχει δε, υπάρξει διεθνής με τις μικρές Εθνικές ομάδες.

Είναι πτυχιούχος του τμήματος Μηχανολόγων Μηχανικών του ΑΠΘ.