Ο Βασίλης Καναράς εργάστηκε στα Τμήματα Υποδομής του ΠΑΟΚ από το 2012, ενώ από τις αρχές του 2014 ανέλαβε χρέη γυμναστή αποκατάστασης, όπως και υπεύθυνου προπόνησης των δανεικών παικτών της πρώτης ομάδας της ΠΑΕ ΠΑΟΚ. Από την σεζόν 2016-17 προωθήθηκε στην πρώτη ομάδα.

Είναι πτυχιούχος του ΤΕΦΑΑ, κατέχει μεταπτυχιακό τίτλο σπουδών στην κινησιολογία, δίπλωμα προπονητή ποδοσφαίρου UEFA A, πτυχίο UEFA Elite Youth και πτυχίο Corrective Exercise Specialist.

Στο παρελθόν, το 2006, ήταν προπονητής στην ακαδημία Πρωταθλητές, από το 2007 έως το 2012 στην ακαδημία Α.Ο. Λέοντες και το 2011 ανέλαβε προπονητής ποδοσφαίρου στις κορασίδες του Α.Σ. ΠΑΟΚ.